Транспортные вузы Петрозаводска находятся под опекой Минтранса РФ. Несмотря на реформу 2005 г. и тесную связь среднего профессионального образования с вузовской наукой, высшее образование для абитуриентов остается в приоритете. Железнодорожный институт - один из лидеров по подготовке и переподготовке кадров. Университет путей сообщения всегда считался престижным заведением. Известно, что можно найти свою нишу в бизнесе, закончив институт транспорта, т.к. он все больше зависит от путей сообщения и скорости доставки услуги или товара. О многом говорит партнерство вузов с РЖД, Московским метрополитеном; участие в международных проектах под эгидой ЕС, сотни патентов. Многие транспортные вузы Петрозаводска начали свою историю пару сотен лет назад. За прошедшее время вузы Петрозаводска накопили богатую научную базу, имеют в преподавательском составе профессоров, докторов, кандидатов наук, стоящих во главе исследовательских работ. Крупнейшим научным комплексом является академия водного транспорта. Она включает институт, лицей, филиалы, десятки кафедр.
